Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms