Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms