Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms