Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms