Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms