Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms