Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC9Q8TBE3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms