Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA3Q8TBC4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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