Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms