Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246 ms