Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD1Q8NBU5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms