Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH13Q8NBN7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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