Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms