Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms