Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG4DQ86TL0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms