Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms