Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms