Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZRN4Q6ZMN7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms