Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A10Q6U841 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms