Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASC1Q6TDU7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC1Q6TDU7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms