Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms