Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BLOC1S2Q6QNY1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms