Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms