Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KANK3Q6NY19 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KANK3Q6NY19 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms