Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB12Q6NXP0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms