Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms