Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS3Q68E01 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS3Q68E01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms