Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOCADQ5VW36 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms