Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD1Q5VV17 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD1Q5VV17 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms