Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms