Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms