Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01559Q495D7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01559Q495D7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms