Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms