Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TTLL9Q3SXZ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms