Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB5Q2M3G0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB5Q2M3G0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms