Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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