Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PTPRNQ16849 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPRNQ16849 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPRNQ16849 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPRNQ16849 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPRNQ16849 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRNQ16849 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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PTPRNQ16849 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPRNQ16849 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRNQ16849 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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