Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN1Q16658 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms