Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms