Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCOA1Q15788 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
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NCOA1Q15788 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCOA1Q15788 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
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