Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUM3Q15397 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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