Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3CQ15386 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms