Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN1Q15223 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
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