Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD3Q15054 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms