Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KARSQ15046 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KARSQ15046 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KARSQ15046 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KARSQ15046 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KARSQ15046 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KARSQ15046 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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