Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME4Q14997 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME4Q14997 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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