Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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