Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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GBX1Q14549 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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