Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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