Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBI3Q14213 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms